科學(xué)家發(fā)布 版本的人類蛋白質(zhì)圖譜 或?qū)⒊蔀檫M行代謝模型研究的基礎(chǔ)
時間：2016-04-18 13:52 來源：川北在線整理 責(zé)任編輯：沫朵
原標(biāo)題：科學(xué)家發(fā)布 版本的人類蛋白質(zhì)圖譜 或?qū)⒊蔀檫M行代謝模型研究的基礎(chǔ)
近日，刊登在國際雜志Molecular Systems Biology上的一項研究報告中，來自查爾姆斯理工大學(xué)的研究人員通過研究發(fā)布了第15版的人類蛋白質(zhì)圖譜(Human Protein Atlas)，新版本中包括了來自不同數(shù)據(jù)來源的大量研究數(shù)據(jù)，為后期對比不同組織樣本之間的RNA和蛋白質(zhì)水平提供了新的思路和研究基礎(chǔ)。
深入揭示人類組織或細(xì)胞的健康和疾病狀況或可幫助科學(xué)家們更好地闡明疾病發(fā)生的特殊機制，而進行相關(guān)的對比，研究者們首先就需要知曉我們?nèi)祟悪C體的構(gòu)成，其中一個方法就是分析轉(zhuǎn)錄組，這意味著要深入發(fā)現(xiàn)哪些組織或細(xì)胞樣本中的哪些基因是被激活來產(chǎn)生蛋白質(zhì)的。
人類的蛋白質(zhì)圖譜計劃包括對靶向超過1.7萬個特殊蛋白的2.5萬多個抗體進行蛋白質(zhì)組的分析，同時還結(jié)合對2萬個蛋白編碼基因的轉(zhuǎn)錄組學(xué)進行分析；而研究者在4月11日發(fā)布的人類蛋白質(zhì)圖譜新版本中則包括多個數(shù)據(jù)來源中心的原始數(shù)據(jù)，其就為后期從事比較性的研究提供了研究數(shù)據(jù)；新版本的蛋白質(zhì)圖譜對不同的人類組織的轉(zhuǎn)錄組進行了圖譜的繪制，相比此前版本這是一項巨大的進步，而且這些數(shù)據(jù)或?qū)⒊蔀檫M行后期代謝模型研究的基礎(chǔ)。
文章中，研究者描述了新型的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)資源，他們重點對比了來自博德研究所、波士頓、GTEx等機構(gòu)的研究數(shù)據(jù)庫；GTEx數(shù)據(jù)庫中包含了超過1600個樣本，對其中28個樣本進行RNA測序研究，同時將研究結(jié)果同人類蛋白質(zhì)組圖譜進行一致性對比或許就可以幫助科學(xué)家們對比人類蛋白質(zhì)組圖譜和GTEx數(shù)據(jù)庫之間的差異和關(guān)聯(lián)。
同時研究者還在文章中討論了公開的人類轉(zhuǎn)錄組資源以及這些數(shù)據(jù)庫的多方面應(yīng)用價值，比如構(gòu)建基因組尺度的代謝模型用來分析健康和疾病個體機體中的細(xì)胞和組織的功能；后期研究人員還將通過更為深入的研究來利用新版本的人類蛋白質(zhì)組圖譜來對人類多種疾病的發(fā)病機制進行剖析和研究。
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